（一）所得税率优惠。
高新技术企业享受15%的优惠所得税率，相当于在原来25%的基础上降低了40%。
（二）“两免三减半”（取消）。
原深圳特区以内，2008年1月1日以后成立的企业自取得第yi笔生产经营收入所属纳税年度起，第yi年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按照25%的法定税率减半征收企业所得税。
（三）人才安居奖励补贴。
高新技术企业可以推荐一位本公司的深圳高层次人才申请奖励补贴，补贴标准为：龙华新区240万（50%配套），宝安区320W（百分之百配套），光明区240万（50%配套），福田区170万（10万），龙岗区240万（50%配套），其他区域均160W。
（四）高新技术企业符合条件的技术转让所得免征、减征企业所得税。
一个纳税年度内，居民企业技术转让所得不超过500万元的部分，免征企业所得税；超过500万元的部分，减半征收企业所得税。
（五）高新技术企业固定资产加速折旧。
允许加速折旧的固定资产包括：1、由于技术进步，产品更新换代较快的固定资产；2、常年处于强震动、高腐蚀状态的固定资产。
采取缩短折旧年限方法的，至低折旧年限不得低于本条例第六十条规定折旧年限的60%；采取加速折旧方法的，可以采取双倍余额递减法或者年数总和法。
（六）研发费用加计扣除。
企业为开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照企业研究开发费用的75%加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的175%摊销。
（七）取得国高新技术企业证书后可享受各区相应认定补贴，如下所示：
| 深圳市及各区国高新技术企业认定奖励 | ||
| 地区 | 首认定 | 复审 |
| 深圳市 | 5万 | 5万 |
| 龙华区 | 30万 | 20万 |
| 宝安区 | 30万 | 10万 |
| 光明区 | 30万 | 10万 |
| 南山区 | 20万 | 10万 |
| 龙岗区 | 30万 | 10万 |
| 福田区 | 30万 | 15万 |
| 罗湖区 | 30万 | 10万 |
| 坪山区 | 30万 | 30万 |
| 大鹏新区 | 20万 | 5万 |
| 盐田区 | 30万 | 5万 |
| 市高奖励：大鹏新区10万，坪山区5万，罗湖区培育入库5万。 |
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（八）进入高新区股份代办系统进行股份报价转让的高新技术企业，予以至高180万元资助。
（九）高新企业认定是新三板上市的必备条件，优先批准符合上市条件的股份制高新技术企业股票上市。
（十）高新技术企业认定是申请各级相关政府资金的必备条件之一。
（十一）高新技术企业可优先获得办公及工业用地的获批。
（十二）深圳市每年从债券发行总额中拨出20%的额度给符合发行条件的高新技术企业。
（十三）在2008-2020年，深圳将建成500万－600万平方米创新型产业用房，支持高新技术产业发展。
（十四）高新技术企业认定将有效地提高企业的科技研发管理水平，重视科技研发，提高企业核心竞争力，能为企业在市场竞争中提供有力的资质，极大地提升企业品牌形象，无论是广告宣传还是产品招投标工程，都将有非常大的帮助。
（十五）高新技术企业对于任何企业都是一个难得的资质认证，对依靠科技立身的企业更是不可或缺的硬招牌，其品牌影响力仅次于中国有名的产品、中国商标、产品。